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新疆维吾尔自治区胸科医院
新疆维吾尔自治区胸科医院始建于1958年，其前身是自治区肺科医院（自治区结核病防治研究院），隶属于自治区卫生厅，是集医疗、预防、科研、教学为一体的技术力量雄厚、设备先进、服务优良的以治疗胸部疾病为主的大型三级专科医院，是全疆唯一的自治区级结核病诊治医院以及自治区结核病/艾滋病双重感染定点医院。
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新疆维吾尔自治区职业病医院
新疆维吾尔自治区职业病医院（原新疆煤矿总医院）位于乌鲁木齐市沙依巴克区南昌路，始建于1958年10月，是国家二级甲等医院、爱婴医院、国家矿山医疗救护乌鲁木齐分中心、中国煤矿尘肺病治疗基金会定点医院、自治区工伤康复医疗定点机构，是自治区卫生厅、教育厅联合授予的临床实习医院、新疆农业大学药学院实习基地，是沙依巴克区八一街道社区卫生服务中心、自治区级文明单位、自治区级卫生红旗单位，是自治区及乌鲁木齐市城镇职工基本医疗保险定点机构。
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新疆维吾尔自治区人民医院
新疆维吾尔自治区人民医院始建于1934年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健和社区卫生服务为一体的大型综合性“三级甲等医院”。
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新疆医科大学第一附属医院
新疆医科大学第一临床医学院暨第一附属医院（原名为新疆医学院附属医院），一九五六年建院。五十余年来经过几代创业者艰苦努力，现已形成一所集医疗、教学、科研为一体的大型综合性教学医院和高级医学人才的培养基地。
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新疆维吾尔自治区中医医院
新疆维吾尔自治区中医医院暨新疆医科大学附属中医医院、新疆中医药研究院及新疆中医名医名方研究开发中心，目前是中国西北地区规模最大的综合性三级甲等中医医院。
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新疆肿瘤医院
新疆维吾尔自治区肿瘤医院暨新疆医科大学附属肿瘤医院、新疆医科大学第三附属医院、新疆医科大学第三临床医学院成立于1989年12月，是自治区唯一一所集医疗、教学、科研、预防和继续医学教育为一体的三级甲等肿瘤专科医院。新疆维吾尔自治区肿瘤防治研究所、自治区肿瘤防治办公室、自治区抗癌协会、自治区放射治疗质量控制中心等机构挂靠在我院。
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新疆乌鲁木齐市友谊医院
乌鲁木齐市友谊医院（乌市第三人民医院）创建于1948年，现已发展成为乌鲁木齐市唯一一所集医疗、预防、教学、科研、保健、康复为一体拥有四家分院的国家级三级甲等医院、国家级爱婴医院、卫生部“国际紧急救援中心”，“亚洲紧急救援中心”定点医院及新疆医科大学临床医学院、自治区全科医师培训中心实践教学基地、新疆石河子医学院教学医院。医院先后荣获“全国卫生系统先进集体”、“全疆十佳医院”和“自治区级文明单位”等荣誉称号。
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